FoundationOne / Molekulares-Tumorprofiling

FoundationOne®Services liefern ein umfassendes molekulares Tumorprofil von soliden Tumoren oder hämatologischen Erkrankungen, das Ärzte und Ärztinnen in ihren Therapieentscheidungen für Krebspatienten und Krebspatientinnen unterstützen kann, indem es die krebsassoziierten genetischen Veränderungen ermittelt.

FoundationOne®CDx für solide Tumore aus FFPE Biopsien

  • Validerte NGS-basierte Analyse der vier wichtigsten Klassen genomischer Veränderungen (Basensubstitutionen, Insertionen/Deletionen, Kopienzahlvariationen und Genrekombinationen).
  • Sequenzierung der gesamten Kodierungssequenz von 324 Genen und Introns zur Bestimmung der Fusionen aus 36 ausgewählten Genen.
  • Bestimmung des Tumor Mutational Burden (TMB) und der Microsatellite Instability (MSI).
  • Der FoundationOne®CDx Test ist ein von den amerikanischen Gesundheitsbehörden zugelassener Test für die molekulare Tumordiagnostik.

Umfassender Ansatz liefert zuverlässige Ergebnisse

  • Erkennt alle Klassen von genetischen Veränderungen – Basensubstitutionen, Insertionen/Deletionen, Kopienzahlvariationen und Genrekombinationen.
  • FoundationOne®CDx ist ein umfassendes Tumorprofil, das auf einer Validierungsstudie basiert, welche die branchenführende Genauigkeit des Verfahrens belegt und in einer anerkannten wissenschaftlichen Fachzeitschrift veröffentlicht wurde.

Spart Gewebematerial und Zeit

  • Benötigt nur eine geringe Menge an Gewebe, einschliesslich Routine-Biopsate und Feinnadelaspirate.
  • Funktioniert auch bei Proben mit hohem Anteil an nicht-Tumorzellen.

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Probenleitfaden CDx

FoundationOneLiquid®CDx für Liquid Biopsy solider Tumore

  • FoundationOne®Liquid CDx detektiert die vier Hauptklassen der genomischen Veränderungen in 324 krebsrelevanten Genen und weist den Status der Mikrosatelliteninstabilität (MSI) sowie die Tumormutationslast im Blut (bTMB) aus.
  • Die hohe Spezifität und Sensitivität gewährleisten, dass Sie auf die gefundenen und im Bericht ausgewiesenen Genalterationen vertrauen können. Die Tumorfraktion gibt den prozentualen Anteil von zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) in zellfreier DNA (cfDNA) an. Dieser Prozentsatz basiert auf der in der Probe beobachteten aneuploiden Instabilität. Je mehr anomale Zellen vorliegen, desto höher ist die Tumorfraktion
  • Der FoundationOne(R)CDx Test ist ein von den amerikanischen Gesundheitsbehörden zugelassener Text für die molekulare Tumordiagnostik.

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Probenleitfaden Liquid CDx

FoundationOne®Heme für hämatologische Erkrankungen und Sarkome

  • Validerte NGS-basierte Analyse der vier wichtigsten Klassen genomischer Veränderungen (Basensubstitutionen, Insertionen/Deletionen, Kopienzahlvariationen und Genrekombinationen).
  • DNA-Sequenzierung der gesamte Kodierungssequenz von 406 Genen und Introns zur Bestimmung von Fusionen aus 36 ausgewählten Genen.
  • RNA-Sequenzierung von 265 Genen, die häufig im Tumor rekombiniert sind, um bekannte und neue Fusionspartner besser zu identifizieren.
  • Bestimmung des Tumor Mutational Burden (TMB) und der Microsatellite Instability (MSI).
  • Die DNA- und RNA-Sequenzierung erfolgt zu einer medianen Abdeckung von 500x, es werden so ca. 6.9 Millionen einmalige Basenpaare analysiert.

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Probenleitfaden Heme

Anwendbare Ergebnisse zusammengefasst in einem Bericht

Alle ermittelten klinisch relevanten genetischen Veränderungen werden auf Grundlage des aktuellen wissenschaftlichen Kenntnisstands und veröffentlichter klinischer Daten mit zielgerichteten Therapien und klinischen Studienprogrammen abgeglichen.

Beispielbericht FOne®CDx

  1. Frampton GM et al. Development and validation of a clinical cancer genomic profiling test based on massively parallel DNA sequencing. Nat Biotechnol 2013;31(11):1023–1031
  2. Chalmers ZR et al. Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden. Genome Med 2017;9(1):34
  3. He, J et al. Integrated genomic DNA/RNA profiling of hematologic malignancies in the clinical setting. Blood 2016; 127(24):3004-3014.

Auskunft Leitung

Martin Zoche, Dr. rer. nat.

Leitender Molekularbiologe, Institut für Pathologie und Molekularpathologie

Tel. +41 79 788 91 57

Kooperationspartner

Dieser diagnostische Test wird in einer Kollaboration von:

  • Hoffmann La Roche AG,
  • Foundation Medicine®Inc
  • und dem Universitätsspital Zürich

angeboten.